在《轩辕剑格斗版》中,玩家们将扮演一位肩负重任的驱魔少年,历经千辛万苦遍寻世界的每一个角落,集齐散落在世间各地的七把神器,前往天之痕对抗入侵的魔族。
不料,在途中少年却遇到了一位头戴面具手持轩辕剑的魔王护法,在费力打碎其面具之后,少年却发现此人正是天女画像中的轩辕黄帝!满腹疑惑的少年后经天女协助唤醒昏迷的轩辕黄帝,从黄帝口中得知,原来魔族的入侵背后却与天界有着千丝万缕的关系!
少年虽不知天界的阴谋用意,但是当下的首要任务还是要打败魔王封印魔界入口。于是,驱魔少年和宇文拓等人进入魔界,借助上古十大神器的力量布下失却之阵,一举击败了魔王!然而,魔王在临死前却透露出一个惊天秘密:少年与魔王不过是天界手中的棋子,破坏天界的好事终将承受天界的怒火。当少年和宇文拓一行人想封印天之痕时,天界之门却在这时出现……